O Departamento Nacional de Infraestrutura dos Transportes – DNIT é o órgão federal responsável pela operação das rodovias, ferrovias e vias navegáveis da União. Dentre os 55 mil km de rodovias administrados pelo DNIT, a NÚCLEO já participou da supervisão de vários trechos, com destaque para a duplicação da BR-364 no Mato Grosso; a restauração da BR-319, que corta a floresta amazônica e a duplicação da BR-116 no trecho que une São Paulo ao sul do país, além de projetos rodoviários de implantação e duplicação em vários estados.
